如果说北衙禁军的主要职责职能是专职宿卫皇帝和宫廷，是皇帝的私人亲军，相当于今天的贴身保镖，那么南衙禁军的主要职责职能就是守卫京师长安的安全。相当于今天的卫戍部队。
南衙禁军的主体：
一十二卫1、左右卫
2、左右骁卫
3、左右武卫
4、左右威卫
5、左右领军卫
6、左右金吾卫
二1、左右千牛卫
2、左右监门卫
南衙禁军的职责职能：1、京城的巡逻警卫。
2、朝廷的仪仗护卫。
3、南衙政府机关的保卫和门禁守卫。
所谓京城，是指宫城皇城以外的生活区和商业区。对长安城而言，京城应该就是除大明宫太极宫兴庆宫之外的长安城。
所谓仪仗护卫是指，皇帝上朝接待群臣百官，处理朝政，接待外宾等重要场合的隆重仪式和严格的警卫保护工作。
仪仗护卫工作都由南衙十二卫负责。
十二卫，还是统帅外地到京师长安来番上的各地府兵的中央军事机关。
十二卫还是负责京城和皇城的宿卫的警卫机关。
所谓南衙政府机关就是南衙，又叫南司，位置就在皇城里，也就是大明宫南部的外朝区，大唐的中书省门下省和尚书省等宰相官署，也就是大唐政府的中央机关就在这里。
南衙十六卫，即南衙禁军统属宰相管辖。是国家的军队。
(一)左右卫
组织结构：
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
长史各一人从六品上
录事参军事各一人正八品上
仓曹参军事各二人正八品下
兵曹参军事各二人正八品下
骑曹参军事各一人正六品下
胄曹参军事各一人正六品下
司阶各二人正六品上
中候各三人正七品下
司戈各五人正八品下
执戟各五人正九品下
奉车都尉各五人正五品下
亲勋翊五府是指亲府、勋一府、勋二府、翊一府、翊二府。
亲勋翊五府中每府的组织结构：
中郎一人正四品下？
中郎将一人正四品下
左右郎各一人正五品上
录事参军事一人正九品上
兵曹参军事一人正九品上
校尉五人
旅帅十人
队正二十人
副对正二十人
左右卫的权力和职责：
1、左右卫将军的权责，掌统领宫廷警卫之法，以督其属之队仗，总诸曹之职务。
2、凡亲勋翊五中郎将府及冲折府所隶，皆总制之。
3、凡宿卫，内廊阁门外，分为五仗，一供奉仗，二亲仗，三勋仗，四翊仗，五散手仗，皆坐于东西廊下。若御坐正殿，则为黄旗仗，分立于两阶之次，在正门之内，以挟门队坐于东西厢，皆大将军守之。
4、左右卫长史的权责：掌判诸曹、亲勋翊五府及武安、武成等五十府之事。
5、诸曹参军事的权责：掌本曹勾检之事，随曹各有府史。
6、中郎将的权责：掌领本府之属以宿卫。左右郎将副之。若大朝会、巡幸，以卤薄之法以领兵仪仗。
(二)左右骁卫
组织结构
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
其余，长史、录事参军事、仓、兵、骑、胄四曹参军事、人数、品秩如左右卫。
司阶、中候、司戈、执戟等四种，人数、品秩如左右卫。
校尉、旅帅、队正、副队正等人数如左右卫。
翊府中郎将、左右郎将，权责如左右卫。
左右骁卫将军的权责如左右卫。大朝会在正殿之前，以黄旗队及胡禄队坐于东西廊下，若御坐正殿，以其队仗次立于左右卫下。
(三)左右武卫
组织结构
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
长史、录事参军事、仓、兵、骑、胄四曹参军事、司阶、中候、司戈、执戟等人数、品秩皆如左右卫。
翊府中郎将、左右郎将、录事参军事、兵曹参军事等，人数、品秩如左右卫。
左右武卫的权责如左右卫。大朝会，披白铠甲，执器盾及旗等。陛称长唱，警持鈒队，应陛为左右厢仪仗。在正殿之前，左右武卫诸队次立于左右骁卫之下。
(四)左右威卫
组织结构
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
长史、录事参军事、仓、兵、骑、胄四曹参军事职责权力、人数、品秩皆如左右卫。
司阶、中候、司戈、执戟等人数、品秩如左右卫。
翊府中郎将、左右郎将、录事参军事、兵曹参军事、校尉、旅帅、队正、副队正等人数、品秩皆如左右卫之亲府。
左右威卫的权责
大朝会，披黑铠甲，执弓箭刀盾旗等，分左右厢队，在正殿之前，次立于武卫之下。
(五)左右领军卫
组织结构
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
长史、录事参军事、仓、兵、骑、胄四曹参军事、司阶、中候、司戈、执戟等人数、品秩如左右卫。
翊府中郎将，左右郎将，录事参军事、兵曹参军事、校尉、旅帅、对正、副队正等人数、品秩权力和职责如左右卫。
左右领军卫的权责：大朝会，披青铠甲，执弓箭刀盾旗等，分左右厢仪仗，次立于威卫之下。
(六)左右金吾卫
组织结构
大将军各一人正三品
将军各二人从三品
长史、录事参军事、仓、兵、骑、胄四曹参军事、司阶、中候、司戈、执戟等人数、品秩权责如左右卫。
翊府中郎将、左右郎将、兵曹参军事、校尉、旅帅、队正、副队正等人数、品秩权责如左右卫。
左右金吾卫的权责：
1、掌宫中及京城昼夜巡警之法。以执御非违。
2、凡翊府及同轨等五十府，皆属之。
3、凡车驾出入，则率其属以清游队，建白泽朱雀等旗队先驱，如卤薄之法。
4、从巡狩田猎，则执其左右营卫之禁。
5、凡翊卫、翊府、同轨、宝图等五十府彍骑卫士番上者，各领所职。
以上，就是南衙十二卫。
