ImageJ的功能很多(这是为什么我们一直在做ImageJ教程的一个原因),而且基本都是自动操作。今天我们就来看看ImageJ是如何来计算实验照片中颗粒的粒径,尤其是圆形纳米颗粒的。


如何分析细胞粒径?

1.File-Open,打开待分析示例图片(DAPI染核):


2.设置标尺,可得到实际粒径而不是像素。


、按住Shift在标尺上画直线


Analyze-SetScale,在已知距离中填入10μm,选择Global则校正标尺对本次打开所有图片均有效。


3.转化为8-bit灰度图片:Image-Type-8-bit。


选中待分析粒子:

Image-Adjust-Threshold调节阈值,选择所有阳性信号(红色代表选中,背景为黑色勾选Darkbackground):


在ImageJ软件Analyze下选择SetMeasurements设置测量参数,



Feret’sdiameter直径为某一形状边界任意两点之间的的最长距离,也称为最大距离。

4.在ImageJ软件Analyze下选择AnalyzeParticles,选择Displayresults和AddtoManager:



5.

ROIColorCoder插件通过将测量值与查找LUT匹配来生成粒度大小的热图,从而对ROIManager选择进行着色:


官网ROIColorCoder插件界面如下:




如何得到粒径分布图?

1.。



3.得到粒径分布图,从图中可知共有24个粒子(N=24),粒径最大值为148.56(Max:148.56),均值Mean:56.28,中位数Median为63.54,最小值Min:2.24,标准差SD为41.32,组间距为45.75,分为4组。粒径0-50之间的有9个,50-100之间的粒子有12个。


此外也可以使用Origin软件进行绘制,File-Saveas保存为Excel文件:


打开Excel文件,将Feret列数据拷贝到Origin中:




可得到粒径的频数分布情况:


绘制粒径分布图,美化即可:



总结

测量粒径以及粒径分布遵循以下原则,即先选中、后测量。能够准确选中后,选择需要测量的参数即可,之后将得到的参数绘制分布图及其他操作。

今天的ImageJ分析粒径给大家这里,希望对大家有所帮助!

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